李长歌母亲阿瑾的真正死因一直没有道明真相，长歌误以为李世民是凶手，其实阿瑾并不是李世民所杀。就目前来看，阿瑾或是自杀，或是他杀，而自杀的概率更大一些。因为她毕竟是李建成的妻子，但她听闻李建成可能会做出对李世民不利的事情，所以才通知李世民，导致惨案发生。阿瑾可能是因为愧疚所以选择自尽，后来长歌也是得知真相。
1、阿瑾死亡真相
渭水之战，李长歌为了家国大义，所以没有杀为了守护长安而冒死御驾亲征的李世民，但并不代表李长歌不恨李世民，毕竟是他夺取了属于自己父亲的皇位，也是他傻了自己的母亲。只不过后来李长歌去了草原，成为涉尔的奴隶，又为了救罗义差点被杀，后来到了流云观，为了鹰师去漠北，这些事情令她对于复仇没了心思。
但这一次李长歌为了大漠会盟，团结大漠的力量和大唐联手，一起对付阿诗勒部，以漠北郡主的身份前往长安，他祭拜自己母亲的时候却遇上了李世民，李长歌对李世民表现除了足够的恨意，不过后面魏征的话却揭开了李长歌的身世来历，更揭晓了她母亲之死的真相。
原来李长歌的母亲是李世民外出征战的时候救回来的，两人互相相爱，但可惜的是李世民常年征战在外，而有一次李建成喝醉酒，将阿瑾当成了自己的妃子，居然玷污了阿瑾，等到李世民回来的时候阿瑾已经怀上了李长歌。
后来李长歌出生，和李世民很有缘分，也是李世民把她带大，因此长歌对李世民非常亲近，反而是李建成并不喜欢李长歌。而且后来李建成想要杀李世民，却被阿瑾给听到了，所以她写信告诉李世民，这才令李世民有了防备，反杀成功。
2、魏征道出真相
魏征的话令李长歌知道了自己母亲和李世民之间的恩怨，但令她疑惑的是李世民既然爱着自己的母亲，阿瑾还向李世民报信，李世民为何要杀了她?而魏征的话也暗示了阿瑾真正的死因。魏征说：“有时候眼睛看到的，未必是全部真相”。
魏征的话暗示了一点，那就是李世民没有杀阿瑾，或者说这些都只是假象，真正的答案他虽然没有明说，但已经暗示了，既然李世民没有杀阿瑾，最大的可能就是阿瑾被李建成所杀，因为阿瑾通风报信了。当然也有人说阿瑾就不能是自杀么?这一点很简单，看她死的时候脖子上的伤痕就知道，握着一柄短刀，自杀的伤口不可能是平的。听了这一句话之后，长歌才知道自己狠错人了。
当然还有一个疑惑，那就是地上为何有李长歌给李世民的短刀?当初李长歌女扮男装去和阿隼比试蹴鞠，赢得这柄短刀，她把刀送给了李世民，但因此被阿瑾打了一巴掌，阿瑾的心中是心疼李长歌的，李世民把这刀给阿瑾，让她为自己的女儿骄傲，这也是很正常的，而李建成要杀阿瑾，从她手中夺刀杀她，自然是轻而易举。
所以说李长歌母亲之死的真相其实非常残酷，是她的生父杀了她的生母，李世民看到阿瑾死后失魂落魄，自然去找杀她的人报仇。当然这是剧中的改编，这段魏征没有明说，不同的人有不同的看法，你是怎么看的呢?
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